Lygaria Bay, op slechts 25-30 minuten van Heraklion, is het op één na grootste georganiseerde strand in Agia Pelagia. Het ligt ten oosten van het hoofdstrand en is rustiger, vooral op weekdagen. Het strand heeft ruime ligbedden, goed zwemwater, voldoende parkeergelegenheid en faciliteiten voor omkleden, wassen en toegankelijkheid.
