Η βόρεια είσοδος του Φαραγγιού των Μύλων βρίσκεται λίγα χιλιόμετρα νότια της πόλης του Ρεθύμνου, εύκολα προσβάσιμη με αυτοκίνητο ή ταξί. Η διαδρομή ξεκινάει κοντά στο χωριό Πάνω Μύλοι, όπου υπάρχει χώρος στάθμευσης και πινακίδες.
Το μονοπάτι διασχίζει ένα καταπράσινο και σκιερό φαράγγι γεμάτο με παλιούς εγκαταλελειμμένους μύλους, τρέχοντα νερά, πέτρινα γεφύρια, και πυκνή βλάστηση. Είναι μια ήσυχη και γραφική διαδρομή, ιδανική για φυσιολάτρες, φωτογράφους και οικογένειες.
Η διαδρομή ακολουθεί τη ροή του νερού και είναι κυρίως κατηφορική αν ξεκινήσει κανείς από βόρεια, καταλήγοντας στο χωριό Κάτω Μύλοι ή λίγο πιο κάτω στον δρόμο προς Αμάρι.Ολόκληρη η διαδρομή διαρκεί περίπου 1.5 με 2 ώρες, ανάλογα με τον ρυθμό. Φορέστε άνετα παπούτσια και πάρτε νερό – αν και υπάρχουν φυσικές πηγές στο μονοπάτι!